Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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