Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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