Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl11Q9CQF0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms