Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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