Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SdhbQ9CQA3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SdhbQ9CQA3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms