Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubl4bQ9CQ84 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms