Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms