Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms