Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms