Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrbp1Q99PL5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrbp1Q99PL5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms