Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms