Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atoh8Q99NA2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms