Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd1Q99MV1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms