Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms