Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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