Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nus1Q99LJ8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nus1Q99LJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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