Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms