Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms