Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms