Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ciao1Q99KN2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms