Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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