Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1bQ99JY6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms