Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfxn1Q99JR1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sfxn1Q99JR1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfxn1Q99JR1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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