Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk9Q99J95 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms