Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smim11aQ99J19 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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