Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Letmd1Q924L1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Letmd1Q924L1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms