Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn1Q922Y1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms