Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms