Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Afg3l1Q920A7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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