Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin3bQ91ZU9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms