Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms