Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms