Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nle1Q8VEJ4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms