Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apol9aQ8VDU3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apol9aQ8VDU3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms