Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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