Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep2Q8VCD6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep2Q8VCD6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep2Q8VCD6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep2Q8VCD6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep2Q8VCD6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep2Q8VCD6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms