Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Med17Q8VCD5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms