Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops8Q8VBV7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops8Q8VBV7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms