Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms