Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms