Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml1Q8K558 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms