Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms