Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defb12Q8K4N3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms