Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abca6Q8K441 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abca6Q8K441 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms