Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5rap2Q8K389 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms