Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sash3Q8K352 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sash3Q8K352 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms