Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mrpl47Q8K2Y7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mrpl47Q8K2Y7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mrpl47Q8K2Y7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mrpl47Q8K2Y7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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