Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf628Q8CJ78 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms