Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip10Q8CJ53 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms