Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sphk1Q8CI15 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sphk1Q8CI15 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms